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Illumina chip-seq文庫制備試劑盒48樣本

簡要描述:產品名稱:Illumina chip-seq文庫制備試劑盒48樣本
產品貨號:IP-202-1012
英文名稱:TruSeq ChIP Library Preparation Kit - Set A
產品規格:48 Rxns

  • 產品型號:IP-202-1012
  • 廠商性質:生產廠家
  • 更新時間:2022-03-28
  • 訪  問  量:2055
詳細介紹
品牌illumina/美國因美納供貨周期現貨
應用領域醫療衛生,生物產業

產品簡介:

  ChIP-Seq整合了染色質免疫共沉淀(ChIP)和高通量測序的技術優勢,較ChIP-chip具有更大的開放性和精確性,可實現對任意物種的轉錄調控蛋白全基因組范圍內DNA結合位點,為全面解析基因調控提供了新的支撐技術。ChIP-Seq首先利用抗體特異性地富集蛋白-DNA復合體,然后純化DNA片段,并經末端修復、加A和加測序接頭后,再經低循環數的PCR擴增和瓊脂糖凝膠電泳回收特定大小片段,完成測序文庫制備的工作。構建好的文庫經cBot擴增,用Illumina GAIIx進行測序,并通過生物信息學分析,鑒定出目的蛋白與基因組DNA結合的位點。


產品名稱:Illumina chip-seq文庫制備試劑盒48樣本

產品貨號:IP-202-1012 


產品特點:

產品優勢:

精確性高:基因組結合位點定位精確性可達±50bp。

可靠性高:比ChIP-Chip具有更低的背景,無交叉雜交非特異性。

檢測動力學范圍廣:定量檢測不同結合強度轉錄因子/組蛋白的結合特異性。

全面的分析:可在全基因組范圍內鑒定結合位點,無需候選序列信息。

更經濟的分析:花費只有全基因組ChIP-Chip的1/30~1/10。

更低的起始樣品量:僅需低至10~50ng的免疫沉淀DNA


技術參數:

QQ截圖20220328143533.png


樣本要求:

細胞樣品:單次樣品制備需大于2×107細胞。1%甲醛固定細胞后,PBS清洗細胞3次,離心收集細胞沉淀,液氮速凍,-80℃保存,干冰運輸。

ChIP DNA樣品:樣品量大于50ng,樣品濃度不低于10ng/μl,OD260/OD280為1.8~2.0。DNA片段大小在100~500bp之間,主帶明顯。樣品最好進行過ChIP-PCR驗證。樣品溶于超純水中,放于DNase-free的不黏管中,管口用封口膜封好,干冰運輸。


相關知識:

Illumina二代測序技術,邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術,負責產生世界上90%以上的測序數據。

Illumina的二代測序技術稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復,循環進行。每循環一次測定一個堿基。想測定多少個堿基(即讀長),就循環多少次。測序循環次數可以在軟件里設定。到底測序多長合適,要根據項目性質和需求來決定。大多數情況下,SR實驗(單端測序)測定1x50個堿基,PE實驗(雙端測序)測定2x150個堿基。

1 堿基延伸

Illumina測序試劑里所使用的dNTP特色,它們同時具有兩個修飾基團:一個熒光基團,一個可逆終止基團。可逆終止基團技術是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術一起,構成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩定獲得高質量的測序數據打下了堅實的基礎。

2 信號采集

HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發波長,正好分別用于激發A、G、C、T 4種堿基。

Cluster上所標記的熒光基團在激光激發下產生的信號,可以用相機拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當耗時。對于經典的HiSeq 2000來說,一次測序循環所產生的熒光信號,需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢,時間比測序反應本身還要長。

3 剪切

熒光信號收集完畢后,關閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產物上的堿基所標記的熒光基團和終止基團。兩個修飾基團均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復到自然的可延伸狀態,為下一輪測序做好準備。

再重復合成、激發、收集等步驟,即可進行第二個堿基的測序。


產品訂購信息  

品牌               貨號                         名稱                            規格

Illumina   IP-202-1012   TruSeq ChIP文庫制備試劑盒     12 indexes, 48 Rxns

Illumina   IP-202-1024   TruSeq ChIP文庫制備試劑盒     12 indexes, 48 Rxns


產品名稱:Illumina chip-seq文庫制備試劑盒48樣本

產品貨號:IP-202-1012


關于公司:

Illumina的目標是應用創新技術來分析遺傳變異和功能,實現幾年前甚至還無法想象的研究。我們的任務是提供創新、靈活、可擴展的解決方案以滿足客戶的需求。作為一家重視合作互動、快速交付解決方案和提供高質量水平的全球性公司,我們努力應對這一挑戰。Illumina創新的測序和芯片技術正在推動生命科學研究、轉化和消費者基因組學以及分子診斷中的進展。


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