1. 滿足抗體選擇的基本條件

靶蛋白特異性：確定目的細胞的特異性表面標記或者胞內標記，知道您要檢測什么。 

種屬：嚴格按照待測樣本種屬選擇抗體來源，流式抗體基本無法進行種屬間交叉反應。

應用領域：可用于流式實驗，說明書中明確標注經FC實驗測試，有實驗數據圖和用量說明； 

抗體克隆號：一般選擇參考文獻上提到的克隆；同一抗體多個克隆號的情況下，可以選擇熒光標記種類zui多的那個克隆。

 

2. 確定流式細胞儀的參數配置

在設計流式方案前，根據可能需要同時檢測指標的多少數量，先確定需要在哪臺使用流式細胞儀檢測的型號，對該儀器的參數配置，要了解以下幾個方面信息：

激光器：常見的流式細胞儀有488nm和635nm633nm兩個激光器，但有些機器在購買時因某些原因，只裝了一個488nm激光器，所以需要注意型號相同的機器也未必激光配置相同。

濾光片：也就是有幾個檢測通道，這決定了你zui多可以同時檢測幾個指標。

儀器的具體型號：有助于再次確定檢測通道。因為同一個熒光在不同的流式細胞儀上檢測，有時候檢測通道也是不一樣的。 

 

3. 熒光的選擇建議 

直標還是間標(Biotin)：待測抗原表達高的盡量選擇直標抗體，待測抗原表達豐度低的要考慮選間生物素標記標抗體。

熒光強弱：熒光本身有強弱之分，可視抗原表達強弱及分群情況選擇合適的熒光。如抗原表達弱或分群不明顯的建議選擇強熒光例如：PE、APC；反之，抗原表達強或分群明顯的建議選擇zui常用的弱熒光例如FITC即可（常用熒光強弱排序程度為：PE>APC>PE-cy5Cy5>PercCPp-Cycy5.5>FITC），具體熒光信息請參考熒光染料信息； 

類似熒光的權衡：可以嘗試選擇新型熒光Alexa Fluor、eFluor等。因為這些熒光非常明亮，對激光穩定性好，對PH 值不敏感，具有水溶性。（如Alexa Fluor488與FITC檢測通道相同，但是熒光強度和光敏感上，前者明顯優于后者）

4. 多色熒光搭配的原則

多色分析方案中熒光抗體的選擇和搭配，會受到很多因素的制約，是一個難點：

檢測通道不能沖突：每個檢測通道只能選擇1種熒光素，各通道之間的熒光素可以隨意搭配（如FL1選擇了FITC標記的抗體，就不能再選擇Alexa Fluor488標記的抗體；而同組實驗的其余抗體選擇PE或者APC標記，都是可以隨意組合的）； 

熒光強弱：所選各種熒光素光譜的重疊應當盡量減少，否則將會導致較大的補償。例如，PE-Ccy5與APC同時標記，將會導致補償過度，需換成PE-Ccy5.5或PerCPcp-Ccy5.5。zui常用的4色熒光搭配是：FITC、PE、PercpPerCP-Ccy5.5、APC； 

多色熒光搭配：多色分析往往會因個別抗體熒光素種類極少而受到限制，需要同時參考多家抗體公司的產品進行方案設計。因此如遇5色以上分析需求，建議咨詢萊茲生物。

5. 流式抗體使用劑量

同一個產品通常會提供多個規格供您選購，可以根據實驗的具體樣本量和說明書建議用量來確定抗體用量：

細胞數：通常情況下流式檢測一次的樣本量為106~108個細胞，建議對樣本做細胞計數，以保證抗體標記效果*； 

Test包裝：以test為計量單位的抗體，按照每test細胞懸液體積計算出每次加入多少ul抗體即可； 

Ug包裝：以ug為計量單位的抗體，需要根據說明書每次抗體加入多少ug先算出能使用的次數，再通過總體積算出每次加入多少ul抗體。 

6. 同型對照抗體的選擇

同型對照（Isotype Control），是用于消除由于抗體非特異性結合到細胞表面而產生的背景染色，是真正意義上的流式陰性對照，流式細胞實驗*的一項。

來源：同型對照是使用與一抗相同種屬來源、相同亞型及亞鏈、相同熒光標記的免疫球蛋白，也要求使用相同劑量。同型對照一定要選擇準確，通常在熒光一抗的說明書中，廠家會給出同型對照抗體的貨號； 

純化級別抗體：如果是純化的一抗加熒光標記的二抗，那么應該選擇與一抗相對應的同型對照抗體（如樣品管為：純化的CD3+PE標記的二抗+樣本；則對照管為：純化的同型對照+ PE標記的二抗+樣本）；